上海医药集团股份有限公司中央研究院（简称“上药研究院”）成立于2003年，坐落于上海市浦东新区张江高科技园区内，在集团战略引领下，按照早期发现到新药申报的研发流程重塑优化研发组织架构体系，进行专业化、扁平化运作，按照独立核算的公司化的运营模式开展工作，承担研发责任。下设业务部门小分子研发部、大分子研发部、中药研发部、项目管理部、转化部、质量部、药政部、临床部，职能部门综合管理部、财务部、安全保卫部，党群工作部等。另设下属单位上海医药集团（本溪）北方药业有限公司，承接开展中试业务。

       上海医药集团（本溪）北方药业有限公司（简称上药北方药业）是上海医药集团股份有限公司的全资子公司。上药北方药业设立于2014年11月，位于国家级生物医药产业园——本溪高新区神农大街22号，占地面积7.3万平方米，现注册资本3.8亿元，旨在建设与国际接轨、国内领先的化药全产业链研发中试产业化基地、生物抗体药物的研发中试平台和ADC药物精品制造基地，打造拥有核心竞争力、业内一流的创新药物及高端制剂MAH精品制造基地。